鑒于自然災害對傳染病發(fā)病的上述影響，自然災害后的傳染病防治工作，應有與正常時期不同的特征，且防治的組織領(lǐng)導應是政府有關(guān)部門。根據(jù)災害時期傳染病的發(fā)病特征，可將傳染病控制工作劃分為四個時期。

（一）災害前期

我國是一個大國，一些地區(qū)為自然災害的易發(fā)地區(qū)。因此，在災害發(fā)生前，應有所準備，其中包括傳染病防治工作。

1、基本資料的積累。為災害時期制定科學的防治對策，應注重平時的基本資料的積累，包括人口資料、健康資料、傳染病發(fā)病資料、主要的地方病分布資料以及主要的動物宿主與媒介的分布資料等。

2、傳染病控制預案的制訂。在一些易于受災的地區(qū)、如地震活躍區(qū)，大江大河下游的低洼地區(qū)以及分洪區(qū)等，都應有災害時期的緊急處置預案，其中也應包括傳染病控制預案。預案應根據(jù)每個易受災地區(qū)的具體情況，確定不同時期的防病重點?？晒┡扇霝膮^(qū)的機動隊伍的配置，以及急需的防病物資、器材的儲備地點與調(diào)配方案等，也應在預防中加以考慮。

由于自然災害的突發(fā)性，不可能針對每一個可能受災的地區(qū)制訂預案，應根據(jù)一些典型地區(qū)制定出較為詳細的預案，以作示范之用。

3、機動防疫隊準備。由于自然災害的重點沖擊，災區(qū)內(nèi)往往沒有足夠的衛(wèi)生防疫和醫(yī)療力量以應對已發(fā)生的緊急情況。在突發(fā)性的災害面前，已有的防疫隊伍也往往陷于暫時的混亂與癱瘓狀態(tài)。因此，當重大的自然自然災害發(fā)生后，必須要派遣機動防疫隊伍進入災區(qū)支援疾病控制工作。

4、針對一些易受災地區(qū)，應定期對這些機動隊伍的人員進行訓練，使其對主要機動方向的衛(wèi)生和疾病情況，進入災區(qū)后可能遇到的問題有所了解。在人員變動時，這些機動隊伍的人員也應及時得到補充和調(diào)整，使其隨時處于能夠應付突發(fā)事件的狀態(tài)。

（二）災害沖擊期

在大規(guī)模的自然災害突然襲擊的時候，實際上不可能展開有效的疾病防治工作。但在這一時期內(nèi)，以緊急救護為目的派入災區(qū)的醫(yī)療隊，就應當配備足夠數(shù)量的飲水消毒之地和預防與處理腸道傳染病的藥物，并注意發(fā)生大規(guī)模傳染病的征兆，做出適當處理，以控制最初的疾病暴發(fā)流行。